اگر قارچ تازه‌ای خریده‌اید و هنگام پوست کندن متوجه شده‌اید که قارچ‌ها نرم، چسبناک و بوی نامطبوع گرفته‌اند، احتمالاً به دلیل نگهداری نادرست آن‌هاست. برخلاف تصور رایج، نگهداری قارچ‌ها در ظروف دربسته و بسته‌بندی‌های پلاستیکی کاملاً بسته بهترین روش نیست، زیرا قارچ‌ها پس از برداشت همچنان نفس می‌کشند و نیاز به تبادل هوا دارند.
قرار دادن قارچ‌ها در کیسه‌های پلاستیکی بسته باعث تجمع رطوبت و تسریع فساد آن‌ها می‌شود، در حالی که نگهداری بدون پوشش باعث خشک شدن سریع قارچ‌ها می‌گردد. بهترین راهکار برای نگهداری قارچ‌های تازه و فله، قرار دادن آن‌ها در یک کیسه کاغذی تمیز و مناسب تماس با مواد غذایی و سپس گذاشتن آن‌ها در یخچال است. این روش به کاهش رطوبت اضافی کمک کرده و از خشک شدن سریع قارچ‌ها جلوگیری می‌کند.
اگر قارچ‌ها در بسته‌بندی‌های تجاری مانند سینی‌های پلاستیکی عرضه شده‌اند، توصیه می‌شود آن‌ها را در همان بسته‌بندی اصلی نگهداری کنید. پس از باز کردن بسته، می‌توانید قارچ‌های باقی‌مانده را در کیسه کاغذی قرار دهید. همچنین بهتر است قارچ‌ها را پیش از نگهداری نشویید و فقط هنگام استفاده آن‌ها را تمیز کنید تا از تجمع رطوبت روی سطح قارچ جلوگیری شود. برای پاک کردن قارچ‌ها می‌توانید از دستمال کاغذی مرطوب استفاده کنید یا اگر لازم است، سریع زیر آب سرد بشویید و سپس کاملاً خشک نمایید.
در صورتی که قصد دارید قارچ‌ها را برای مدت طولانی نگهداری کنید، فریز کردن گزینه مناسبی است. قارچ‌ها می‌توانند تا ۹ ماه در فریزر باقی بمانند، اما به دلیل میزان بالای آب، پس از یخ‌زدایی بافت آن‌ها نرم‌تر می‌شود. برای کاهش این مشکل، می‌توانید قارچ‌ها را پس از تمیز کردن و خرد کردن، به صورت خام فریز کنید، یا ابتدا آن‌ها را کمی بخارپز کرده یا در تابه با کمی روغن تفت دهید و سپس فریز نمایید. قارچ‌های منجمد را می‌توان مستقیماً به سوپ‌ها، سس‌ها و غذاهای خورشتی اضافه کرد، اما برای غذاهایی با زمان پخت کوتاه مانند پیتزا، پاستا یا کیش بهتر است ابتدا آن‌ها را در یخچال یخ‌زدایی کنید.
