سیب‌زمینی‌ها پس از برداشت همچنان زنده هستند و به شرایط محیطی مانند نور، دما و رطوبت واکنش نشان می‌دهند. نگهداری نادرست آن‌ها در کابینت‌های گرم یا یخچال نامناسب باعث می‌شود که سریعاً چروکیده، جوانه زده یا سبز شوند. اما با انتخاب محل مناسب، می‌توان سیب‌زمینی‌ها را هفته‌ها سالم و تازه نگه داشت.
به گفته کارشناسان کشاورزی، بهترین دما برای نگهداری سیب‌زمینی بین 6 تا 10 درجه سانتی‌گراد است. این دما باید در محیطی تاریک، خشک و دارای تهویه مناسب حفظ شود. بنابراین، انبار زیرزمین، سرداب یا انباری خنک و بدون یخ‌زدگی گزینه‌های ایده‌آلی هستند. همچنین باید از قرار دادن سیب‌زمینی‌ها در کیسه‌های پلاستیکی بسته خودداری کرد و بهتر است از سبدهای چوبی یا کیسه‌های پارچه‌ای استفاده شود تا هوا جریان داشته باشد.
نور مستقیم باعث سبز شدن پوست سیب‌زمینی و افزایش ماده‌ای به نام سولانین می‌شود که در مقادیر زیاد سمی است. اگر فقط بخش کوچکی سبز شده باشد، می‌توان آن قسمت را جدا کرد، اما سیب‌زمینی‌هایی که کاملاً سبز شده‌اند بهتر است دور ریخته شوند. دمای بالاتر از 10 درجه سانتی‌گراد نیز باعث جوانه زدن و خشک شدن سیب‌زمینی‌ها می‌شود، بنابراین نگهداری آن‌ها در نزدیکی منابع گرما مانند اجاق گاز یا رادیاتور توصیه نمی‌شود.
رطوبت زیاد موجب پوسیدگی و رطوبت کم باعث چروک شدن سیب‌زمینی‌ها می‌شود. تهویه مناسب و محیط خشک اما نه خیلی خشک، تعادل لازم را ایجاد می‌کند.
نگهداری سیب‌زمینی در یخچال نیز توصیه نمی‌شود، زیرا دمای زیر 4 درجه باعث تبدیل بخشی از نشاسته به قند می‌شود که در هنگام سرخ کردن می‌تواند ماده‌ای به نام آکریل‌آمید تولید کند که برای سلامتی مضر است. البته نگهداری کوتاه‌مدت در یخچال در مواقع اضطراری و با برنامه‌ریزی برای پخت آب‌پز یا بخارپز قابل قبول است.
اگر سیب‌زمینی‌ها شروع به جوانه زدن یا لکه‌دار شدن کردند اما هنوز سفت هستند و سبز نشده‌اند، می‌توان جوانه‌ها و قسمت‌های آسیب‌دیده را جدا کرده و سریعاً مصرف کرد. سیب‌زمینی‌های کاملاً نرم، جوانه زده یا سبز شده باید دور ریخته شوند. پس از پخت، غذاهای تهیه شده با سیب‌زمینی را می‌توان فریز کرد تا از هدر رفتن آن‌ها جلوگیری شود.
